Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LtbrP50284 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LtbrP50284 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LtbrP50284 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LtbrP50284 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LtbrP50284 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LtbrP50284 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LtbrP50284 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LtbrP50284 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LtbrP50284 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LtbrP50284 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LtbrP50284 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LtbrP50284 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms