Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtpreP49446 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtpreP49446 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtpreP49446 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtpreP49446 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtpreP49446 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtpreP49446 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtpreP49446 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtpreP49446 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtpreP49446 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtpreP49446 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtpreP49446 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtpreP49446 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PtpreP49446 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtpreP49446 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtpreP49446 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms