Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rpl13P47963 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpl13P47963 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl13P47963 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms