Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pax9P47242 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax9P47242 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax9P47242 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms