Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gdf5P43027 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gdf5P43027 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gdf5P43027 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gdf5P43027 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gdf5P43027 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gdf5P43027 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdf5P43027 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdf5P43027 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdf5P43027 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdf5P43027 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdf5P43027 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdf5P43027 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdf5P43027 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdf5P43027 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Gdf5P43027 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdf5P43027 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms