Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx2-5P42582 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nkx2-5P42582 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nkx2-5P42582 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms