Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sept1P42209 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sept1P42209 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sept1P42209 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sept1P42209 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sept1P42209 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sept1P42209 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sept1P42209 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sept1P42209 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sept1P42209 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sept1P42209 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sept1P42209 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sept1P42209 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sept1P42209 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sept1P42209 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sept1P42209 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sept1P42209 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sept1P42209 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sept1P42209 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sept1P42209 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sept1P42209 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sept1P42209 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sept1P42209 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sept1P42209 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sept1P42209 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sept1P42209 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sept1P42209 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sept1P42209 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sept1P42209 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sept1P42209 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sept1P42209 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sept1P42209 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sept1P42209 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sept1P42209 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sept1P42209 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sept1P42209 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sept1P42209 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sept1P42209 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sept1P42209 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sept1P42209 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sept1P42209 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sept1P42209 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sept1P42209 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sept1P42209 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sept1P42209 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sept1P42209 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Sept1P42209 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sept1P42209 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sept1P42209 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sept1P42209 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sept1P42209 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms