Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Saa4P31532 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Saa4P31532 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Saa4P31532 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa4P31532 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa4P31532 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa4P31532 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa4P31532 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Saa4P31532 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Saa4P31532 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms