Protein–RNA interactions for Protein: P30658

Cbx2, Chromobox protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx2P30658 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cbx2P30658 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cbx2P30658 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cbx2P30658 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cbx2P30658 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cbx2P30658 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cbx2P30658 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cbx2P30658 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cbx2P30658 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cbx2P30658 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cbx2P30658 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx2P30658 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx2P30658 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx2P30658 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx2P30658 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cbx2P30658 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms