Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk4P30285 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk4P30285 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk4P30285 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk4P30285 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk4P30285 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk4P30285 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk4P30285 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk4P30285 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdk4P30285 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdk4P30285 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdk4P30285 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk4P30285 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms