Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pabpc1P29341 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms