Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RxraP28700 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RxraP28700 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RxraP28700 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RxraP28700 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RxraP28700 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RxraP28700 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RxraP28700 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RxraP28700 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RxraP28700 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RxraP28700 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RxraP28700 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RxraP28700 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RxraP28700 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RxraP28700 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RxraP28700 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RxraP28700 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RxraP28700 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RxraP28700 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RxraP28700 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RxraP28700 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RxraP28700 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RxraP28700 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RxraP28700 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RxraP28700 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RxraP28700 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RxraP28700 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RxraP28700 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RxraP28700 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RxraP28700 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RxraP28700 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RxraP28700 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RxraP28700 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RxraP28700 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RxraP28700 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RxraP28700 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RxraP28700 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RxraP28700 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RxraP28700 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RxraP28700 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RxraP28700 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RxraP28700 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RxraP28700 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RxraP28700 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RxraP28700 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RxraP28700 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RxraP28700 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RxraP28700 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RxraP28700 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RxraP28700 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RxraP28700 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RxraP28700 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RxraP28700 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RxraP28700 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RxraP28700 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RxraP28700 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RxraP28700 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RxraP28700 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RxraP28700 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RxraP28700 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RxraP28700 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RxraP28700 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RxraP28700 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RxraP28700 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RxraP28700 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RxraP28700 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RxraP28700 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RxraP28700 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RxraP28700 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RxraP28700 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RxraP28700 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RxraP28700 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RxraP28700 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RxraP28700 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RxraP28700 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RxraP28700 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RxraP28700 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RxraP28700 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RxraP28700 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RxraP28700 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RxraP28700 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RxraP28700 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RxraP28700 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RxraP28700 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RxraP28700 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RxraP28700 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RxraP28700 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RxraP28700 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RxraP28700 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RxraP28700 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RxraP28700 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RxraP28700 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RxraP28700 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RxraP28700 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RxraP28700 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RxraP28700 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RxraP28700 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RxraP28700 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RxraP28700 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RxraP28700 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
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