Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BgnP28653 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BgnP28653 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BgnP28653 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BgnP28653 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BgnP28653 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BgnP28653 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BgnP28653 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BgnP28653 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BgnP28653 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BgnP28653 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BgnP28653 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BgnP28653 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BgnP28653 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BgnP28653 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BgnP28653 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BgnP28653 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BgnP28653 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BgnP28653 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BgnP28653 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BgnP28653 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BgnP28653 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BgnP28653 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BgnP28653 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BgnP28653 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BgnP28653 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BgnP28653 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BgnP28653 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BgnP28653 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BgnP28653 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BgnP28653 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BgnP28653 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BgnP28653 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BgnP28653 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BgnP28653 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BgnP28653 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BgnP28653 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BgnP28653 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BgnP28653 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BgnP28653 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BgnP28653 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BgnP28653 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BgnP28653 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BgnP28653 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BgnP28653 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BgnP28653 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BgnP28653 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BgnP28653 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BgnP28653 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BgnP28653 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BgnP28653 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BgnP28653 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BgnP28653 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BgnP28653 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BgnP28653 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BgnP28653 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BgnP28653 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BgnP28653 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BgnP28653 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BgnP28653 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BgnP28653 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BgnP28653 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BgnP28653 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BgnP28653 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BgnP28653 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BgnP28653 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BgnP28653 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BgnP28653 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BgnP28653 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BgnP28653 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BgnP28653 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BgnP28653 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BgnP28653 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BgnP28653 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BgnP28653 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BgnP28653 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BgnP28653 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BgnP28653 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BgnP28653 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BgnP28653 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BgnP28653 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BgnP28653 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BgnP28653 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BgnP28653 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BgnP28653 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BgnP28653 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BgnP28653 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BgnP28653 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BgnP28653 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BgnP28653 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BgnP28653 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BgnP28653 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BgnP28653 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BgnP28653 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BgnP28653 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BgnP28653 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BgnP28653 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BgnP28653 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BgnP28653 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BgnP28653 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms