Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LoxP28301 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LoxP28301 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LoxP28301 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LoxP28301 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LoxP28301 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LoxP28301 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LoxP28301 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LoxP28301 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LoxP28301 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LoxP28301 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LoxP28301 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LoxP28301 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LoxP28301 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LoxP28301 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LoxP28301 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LoxP28301 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LoxP28301 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LoxP28301 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LoxP28301 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LoxP28301 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LoxP28301 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LoxP28301 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LoxP28301 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LoxP28301 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LoxP28301 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LoxP28301 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LoxP28301 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LoxP28301 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LoxP28301 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LoxP28301 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LoxP28301 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LoxP28301 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LoxP28301 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LoxP28301 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LoxP28301 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LoxP28301 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LoxP28301 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LoxP28301 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LoxP28301 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LoxP28301 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LoxP28301 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LoxP28301 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LoxP28301 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LoxP28301 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LoxP28301 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LoxP28301 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LoxP28301 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LoxP28301 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LoxP28301 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LoxP28301 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LoxP28301 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LoxP28301 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LoxP28301 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LoxP28301 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LoxP28301 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LoxP28301 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LoxP28301 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LoxP28301 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LoxP28301 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LoxP28301 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LoxP28301 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LoxP28301 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LoxP28301 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LoxP28301 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LoxP28301 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LoxP28301 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LoxP28301 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LoxP28301 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LoxP28301 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LoxP28301 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LoxP28301 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LoxP28301 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LoxP28301 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LoxP28301 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LoxP28301 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LoxP28301 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LoxP28301 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LoxP28301 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LoxP28301 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LoxP28301 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LoxP28301 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LoxP28301 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LoxP28301 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LoxP28301 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LoxP28301 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LoxP28301 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LoxP28301 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LoxP28301 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LoxP28301 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LoxP28301 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LoxP28301 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LoxP28301 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LoxP28301 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LoxP28301 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LoxP28301 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LoxP28301 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LoxP28301 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LoxP28301 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LoxP28301 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms