Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gjc1P28229 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gjc1P28229 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms