Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-DMaP28078 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-DMaP28078 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms