Protein–RNA interactions for Protein: P27808

Mgat1, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgat1P27808 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mgat1P27808 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mgat1P27808 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mgat1P27808 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mgat1P27808 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mgat1P27808 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mgat1P27808 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Mgat1P27808 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mgat1P27808 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mgat1P27808 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mgat1P27808 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mgat1P27808 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Mgat1P27808 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Mgat1P27808 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mgat1P27808 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mgat1P27808 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mgat1P27808 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mgat1P27808 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mgat1P27808 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mgat1P27808 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mgat1P27808 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mgat1P27808 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Mgat1P27808 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mgat1P27808 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mgat1P27808 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mgat1P27808 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mgat1P27808 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mgat1P27808 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mgat1P27808 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mgat1P27808 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Mgat1P27808 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mgat1P27808 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mgat1P27808 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mgat1P27808 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mgat1P27808 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Mgat1P27808 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mgat1P27808 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mgat1P27808 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mgat1P27808 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mgat1P27808 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mgat1P27808 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mgat1P27808 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mgat1P27808 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Mgat1P27808 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Mgat1P27808 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Mgat1P27808 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mgat1P27808 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mgat1P27808 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mgat1P27808 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mgat1P27808 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mgat1P27808 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mgat1P27808 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mgat1P27808 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mgat1P27808 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mgat1P27808 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mgat1P27808 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mgat1P27808 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mgat1P27808 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms