Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PdgfraP26618 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PdgfraP26618 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms