Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2af2P26369 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
U2af2P26369 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2af2P26369 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
U2af2P26369 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2af2P26369 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2af2P26369 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2af2P26369 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
U2af2P26369 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af2P26369 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af2P26369 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U2af2P26369 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms