Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RdxP26043 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RdxP26043 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RdxP26043 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RdxP26043 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RdxP26043 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RdxP26043 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RdxP26043 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RdxP26043 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RdxP26043 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RdxP26043 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RdxP26043 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RdxP26043 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RdxP26043 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RdxP26043 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RdxP26043 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RdxP26043 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RdxP26043 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RdxP26043 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RdxP26043 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RdxP26043 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RdxP26043 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RdxP26043 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RdxP26043 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RdxP26043 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RdxP26043 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RdxP26043 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RdxP26043 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RdxP26043 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RdxP26043 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RdxP26043 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RdxP26043 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RdxP26043 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RdxP26043 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RdxP26043 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RdxP26043 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RdxP26043 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RdxP26043 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RdxP26043 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RdxP26043 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RdxP26043 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RdxP26043 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RdxP26043 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RdxP26043 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RdxP26043 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RdxP26043 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RdxP26043 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RdxP26043 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RdxP26043 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RdxP26043 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RdxP26043 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RdxP26043 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RdxP26043 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RdxP26043 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RdxP26043 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RdxP26043 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RdxP26043 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RdxP26043 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RdxP26043 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RdxP26043 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RdxP26043 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RdxP26043 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RdxP26043 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RdxP26043 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RdxP26043 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RdxP26043 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RdxP26043 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RdxP26043 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RdxP26043 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RdxP26043 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RdxP26043 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RdxP26043 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RdxP26043 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RdxP26043 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RdxP26043 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RdxP26043 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RdxP26043 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RdxP26043 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RdxP26043 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RdxP26043 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RdxP26043 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RdxP26043 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RdxP26043 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RdxP26043 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RdxP26043 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RdxP26043 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RdxP26043 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RdxP26043 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RdxP26043 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RdxP26043 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RdxP26043 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RdxP26043 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RdxP26043 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RdxP26043 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RdxP26043 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RdxP26043 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RdxP26043 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RdxP26043 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RdxP26043 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RdxP26043 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms