Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou2f1P25425 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms