Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmnb2P21619 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms