Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ptbp1P17225 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptbp1P17225 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms