Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgfb3P17125 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tgfb3P17125 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms