Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sptan1P16546 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sptan1P16546 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms