Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp53P15975 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp53P15975 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp53P15975 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp53P15975 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp53P15975 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp53P15975 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp53P15975 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp53P15975 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms