Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calb1P12658 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calb1P12658 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Calb1P12658 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calb1P12658 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Calb1P12658 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Calb1P12658 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Calb1P12658 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Calb1P12658 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Calb1P12658 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Calb1P12658 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Calb1P12658 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Calb1P12658 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms