Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem254aP0DN89 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tmem254aP0DN89 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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