Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ndufb1P0DN34 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ndufb1P0DN34 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms