Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UbbP0CG49 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UbbP0CG49 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms