Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Surf1P09925 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Surf1P09925 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Surf1P09925 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Surf1P09925 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Surf1P09925 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Surf1P09925 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Surf1P09925 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Surf1P09925 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Surf1P09925 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Surf1P09925 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Surf1P09925 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms