Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifna9P09235 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ifna9P09235 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ifna9P09235 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms