Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itgb1P09055 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb1P09055 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itgb1P09055 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms