Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifna5P07349 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna5P07349 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms