Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P04212 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P04212 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P04212 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P04212 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P04212 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P04212 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P04212 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04212 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04212 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04212 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04212 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04212 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04212 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04212 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04212 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04212 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04212 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P04212 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04212 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04212 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04212 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04212 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04212 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04212 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04212 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04212 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04212 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04212 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04212 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04212 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04212 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04212 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P04212 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04212 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04212 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04212 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04212 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04212 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P04212 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04212 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04212 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04212 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04212 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04212 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04212 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04212 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04212 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04212 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04212 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04212 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04212 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04212 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04212 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
P04212 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04212 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04212 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04212 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04212 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04212 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04212 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04212 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P04212 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04212 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04212 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04212 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04212 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04212 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04212 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04212 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04212 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04212 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04212 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04212 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04212 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04212 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04212 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04212 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04212 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P04212 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04212 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04212 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04212 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04212 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04212 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04212 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04212 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04212 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04212 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04212 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04212 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04212 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04212 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04212 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04212 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04212 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04212 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04212 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04212 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04212 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms