Protein–RNA interactions for Protein: P01808

Ig heavy chain V region T601, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01808 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01808 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01808 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01808 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01808 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01808 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01808 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01808 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01808 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01808 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
P01808 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01808 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01808 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01808 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01808 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01808 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01808 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01808 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01808 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01808 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01808 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01808 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01808 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01808 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01808 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01808 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01808 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01808 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01808 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01808 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01808 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01808 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01808 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01808 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01808 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01808 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01808 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01808 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01808 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01808 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01808 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01808 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01808 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01808 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01808 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01808 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01808 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01808 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01808 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01808 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01808 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01808 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01808 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01808 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01808 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01808 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01808 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01808 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01808 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01808 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01808 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01808 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01808 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01808 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
P01808 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01808 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01808 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01808 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01808 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01808 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01808 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01808 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01808 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01808 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01808 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01808 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01808 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01808 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01808 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01808 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01808 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01808 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01808 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01808 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01808 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01808 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01808 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01808 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01808 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01808 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01808 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01808 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01808 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01808 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01808 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01808 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01808 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01808 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01808 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01808 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms