Protein–RNA interactions for Protein: P01658

Ig kappa chain V-III region MOPC 321, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01658 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01658 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01658 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01658 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01658 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01658 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01658 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01658 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01658 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01658 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01658 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01658 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01658 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01658 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01658 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01658 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01658 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01658 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01658 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01658 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01658 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01658 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01658 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01658 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01658 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01658 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01658 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01658 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01658 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01658 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01658 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01658 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01658 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01658 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01658 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01658 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01658 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01658 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01658 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01658 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01658 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01658 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01658 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01658 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01658 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01658 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01658 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01658 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01658 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01658 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01658 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01658 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01658 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01658 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01658 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01658 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01658 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01658 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01658 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01658 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01658 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01658 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01658 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01658 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01658 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01658 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01658 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01658 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01658 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01658 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01658 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01658 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01658 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01658 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01658 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01658 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01658 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01658 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01658 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01658 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01658 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01658 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01658 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01658 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01658 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01658 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01658 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01658 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01658 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01658 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01658 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01658 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01658 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01658 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01658 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01658 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01658 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01658 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01658 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01658 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms