Protein–RNA interactions for Protein: P01643

Ig kappa chain V-V region MOPC 173, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01643 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01643 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01643 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01643 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01643 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01643 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01643 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01643 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01643 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01643 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01643 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01643 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01643 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01643 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01643 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01643 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01643 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01643 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01643 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01643 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01643 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01643 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01643 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01643 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01643 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01643 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01643 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01643 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01643 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01643 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01643 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01643 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01643 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01643 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01643 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01643 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01643 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01643 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01643 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01643 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01643 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01643 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01643 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01643 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01643 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01643 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01643 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01643 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01643 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01643 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01643 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01643 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01643 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01643 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01643 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01643 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01643 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01643 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01643 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01643 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01643 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01643 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01643 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01643 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.14
P01643 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01643 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01643 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01643 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01643 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01643 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01643 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01643 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01643 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01643 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01643 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01643 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01643 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01643 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01643 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01643 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01643 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01643 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01643 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01643 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01643 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01643 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01643 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01643 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01643 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01643 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01643 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01643 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01643 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01643 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01643 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01643 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01643 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01643 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01643 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01643 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms