Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C4bP01029 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C4bP01029 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C4bP01029 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C4bP01029 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C4bP01029 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C4bP01029 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C4bP01029 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
C4bP01029 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C4bP01029 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C4bP01029 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
C4bP01029 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C4bP01029 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C4bP01029 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C4bP01029 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C4bP01029 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C4bP01029 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C4bP01029 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C4bP01029 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C4bP01029 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25■■□□□ 1.59
C4bP01029 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C4bP01029 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C4bP01029 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C4bP01029 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25■■□□□ 1.59
C4bP01029 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C4bP01029 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C4bP01029 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C4bP01029 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C4bP01029 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C4bP01029 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
C4bP01029 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C4bP01029 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C4bP01029 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
C4bP01029 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C4bP01029 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C4bP01029 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C4bP01029 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C4bP01029 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C4bP01029 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C4bP01029 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C4bP01029 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C4bP01029 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C4bP01029 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C4bP01029 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C4bP01029 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
C4bP01029 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C4bP01029 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
C4bP01029 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
C4bP01029 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C4bP01029 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C4bP01029 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C4bP01029 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C4bP01029 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C4bP01029 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C4bP01029 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
C4bP01029 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C4bP01029 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
C4bP01029 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
C4bP01029 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
C4bP01029 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C4bP01029 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C4bP01029 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C4bP01029 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C4bP01029 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C4bP01029 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C4bP01029 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C4bP01029 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C4bP01029 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C4bP01029 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C4bP01029 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C4bP01029 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C4bP01029 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C4bP01029 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C4bP01029 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C4bP01029 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4bP01029 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4bP01029 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4bP01029 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C4bP01029 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C4bP01029 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C4bP01029 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C4bP01029 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C4bP01029 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C4bP01029 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C4bP01029 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C4bP01029 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C4bP01029 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C4bP01029 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C4bP01029 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C4bP01029 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C4bP01029 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C4bP01029 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C4bP01029 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C4bP01029 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C4bP01029 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C4bP01029 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C4bP01029 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
C4bP01029 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C4bP01029 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C4bP01029 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms