Protein–RNA interactions for Protein: O88643

Pak1, Serine/threonine-protein kinase PAK 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1O88643 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pak1O88643 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pak1O88643 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pak1O88643 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pak1O88643 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pak1O88643 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pak1O88643 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pak1O88643 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pak1O88643 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pak1O88643 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pak1O88643 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms