Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ComtO88587 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ComtO88587 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ComtO88587 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ComtO88587 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ComtO88587 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ComtO88587 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ComtO88587 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
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ComtO88587 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ComtO88587 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ComtO88587 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ComtO88587 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ComtO88587 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ComtO88587 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ComtO88587 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ComtO88587 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ComtO88587 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ComtO88587 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ComtO88587 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ComtO88587 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ComtO88587 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ComtO88587 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ComtO88587 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ComtO88587 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ComtO88587 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ComtO88587 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ComtO88587 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ComtO88587 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ComtO88587 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ComtO88587 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ComtO88587 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ComtO88587 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ComtO88587 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ComtO88587 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ComtO88587 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ComtO88587 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ComtO88587 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ComtO88587 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ComtO88587 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ComtO88587 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ComtO88587 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ComtO88587 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ComtO88587 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ComtO88587 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ComtO88587 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ComtO88587 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ComtO88587 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ComtO88587 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ComtO88587 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ComtO88587 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ComtO88587 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ComtO88587 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ComtO88587 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ComtO88587 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ComtO88587 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ComtO88587 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ComtO88587 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ComtO88587 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ComtO88587 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ComtO88587 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ComtO88587 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ComtO88587 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ComtO88587 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ComtO88587 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ComtO88587 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ComtO88587 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ComtO88587 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ComtO88587 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ComtO88587 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ComtO88587 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ComtO88587 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ComtO88587 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ComtO88587 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ComtO88587 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ComtO88587 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ComtO88587 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ComtO88587 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ComtO88587 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ComtO88587 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ComtO88587 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ComtO88587 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ComtO88587 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ComtO88587 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ComtO88587 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ComtO88587 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ComtO88587 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ComtO88587 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ComtO88587 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ComtO88587 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ComtO88587 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ComtO88587 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ComtO88587 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ComtO88587 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ComtO88587 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ComtO88587 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ComtO88587 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ComtO88587 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ComtO88587 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ComtO88587 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms