Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfrO88507 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfrO88507 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntfrO88507 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CntfrO88507 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CntfrO88507 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CntfrO88507 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CntfrO88507 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CntfrO88507 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CntfrO88507 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfrO88507 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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