Protein–RNA interactions for Protein: O88253

Gm10226, Mszf39 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10226O88253 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10226O88253 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10226O88253 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms