Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xirp1O70373 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xirp1O70373 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xirp1O70373 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xirp1O70373 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xirp1O70373 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xirp1O70373 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Xirp1O70373 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Xirp1O70373 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Xirp1O70373 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Xirp1O70373 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Xirp1O70373 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Xirp1O70373 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Xirp1O70373 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Xirp1O70373 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Xirp1O70373 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Xirp1O70373 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Xirp1O70373 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Xirp1O70373 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Xirp1O70373 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Xirp1O70373 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Xirp1O70373 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Xirp1O70373 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Xirp1O70373 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Xirp1O70373 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Xirp1O70373 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Xirp1O70373 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Xirp1O70373 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Xirp1O70373 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Xirp1O70373 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Xirp1O70373 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Xirp1O70373 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Xirp1O70373 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Xirp1O70373 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Xirp1O70373 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Xirp1O70373 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Xirp1O70373 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Xirp1O70373 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Xirp1O70373 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms