Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtssO70370 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtssO70370 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtssO70370 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtssO70370 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtssO70370 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtssO70370 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtssO70370 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtssO70370 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtssO70370 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtssO70370 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtssO70370 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtssO70370 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtssO70370 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtssO70370 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtssO70370 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtssO70370 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtssO70370 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtssO70370 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtssO70370 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtssO70370 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtssO70370 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtssO70370 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtssO70370 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtssO70370 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtssO70370 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CtssO70370 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtssO70370 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtssO70370 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtssO70370 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtssO70370 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CtssO70370 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtssO70370 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtssO70370 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtssO70370 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtssO70370 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtssO70370 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtssO70370 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtssO70370 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtssO70370 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtssO70370 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtssO70370 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtssO70370 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtssO70370 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtssO70370 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtssO70370 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtssO70370 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtssO70370 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtssO70370 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtssO70370 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtssO70370 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtssO70370 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtssO70370 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtssO70370 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtssO70370 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CtssO70370 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtssO70370 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtssO70370 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtssO70370 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtssO70370 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtssO70370 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtssO70370 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtssO70370 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CtssO70370 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtssO70370 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtssO70370 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtssO70370 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtssO70370 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtssO70370 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CtssO70370 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtssO70370 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtssO70370 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtssO70370 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtssO70370 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtssO70370 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtssO70370 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtssO70370 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtssO70370 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtssO70370 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtssO70370 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtssO70370 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtssO70370 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtssO70370 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtssO70370 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtssO70370 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtssO70370 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtssO70370 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtssO70370 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtssO70370 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CtssO70370 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CtssO70370 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtssO70370 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtssO70370 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtssO70370 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtssO70370 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtssO70370 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtssO70370 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtssO70370 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CtssO70370 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtssO70370 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms