Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad51dO55230 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rad51dO55230 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rad51dO55230 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad51dO55230 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad51dO55230 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad51dO55230 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad51dO55230 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad51dO55230 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad51dO55230 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad51dO55230 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad51dO55230 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad51dO55230 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad51dO55230 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad51dO55230 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad51dO55230 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad51dO55230 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad51dO55230 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad51dO55230 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad51dO55230 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad51dO55230 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad51dO55230 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad51dO55230 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad51dO55230 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad51dO55230 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad51dO55230 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad51dO55230 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad51dO55230 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad51dO55230 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad51dO55230 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad51dO55230 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad51dO55230 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad51dO55230 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms