Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChkbO55229 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChkbO55229 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChkbO55229 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChkbO55229 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChkbO55229 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChkbO55229 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ChkbO55229 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ChkbO55229 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms