Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pja1O55176 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pja1O55176 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pja1O55176 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pja1O55176 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pja1O55176 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pja1O55176 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pja1O55176 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pja1O55176 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pja1O55176 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pja1O55176 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pja1O55176 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pja1O55176 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pja1O55176 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pja1O55176 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms