Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syngr1O55100 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngr1O55100 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syngr1O55100 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syngr1O55100 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syngr1O55100 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syngr1O55100 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syngr1O55100 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syngr1O55100 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syngr1O55100 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syngr1O55100 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syngr1O55100 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syngr1O55100 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syngr1O55100 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syngr1O55100 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syngr1O55100 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syngr1O55100 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms