Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LatO54957 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LatO54957 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LatO54957 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LatO54957 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LatO54957 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LatO54957 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LatO54957 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LatO54957 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LatO54957 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LatO54957 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LatO54957 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LatO54957 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LatO54957 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LatO54957 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LatO54957 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LatO54957 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LatO54957 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LatO54957 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LatO54957 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LatO54957 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LatO54957 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LatO54957 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LatO54957 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LatO54957 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LatO54957 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LatO54957 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LatO54957 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LatO54957 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LatO54957 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LatO54957 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LatO54957 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LatO54957 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LatO54957 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LatO54957 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LatO54957 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LatO54957 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LatO54957 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LatO54957 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LatO54957 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LatO54957 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LatO54957 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LatO54957 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LatO54957 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LatO54957 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LatO54957 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LatO54957 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LatO54957 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LatO54957 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LatO54957 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LatO54957 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LatO54957 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LatO54957 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LatO54957 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LatO54957 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LatO54957 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LatO54957 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LatO54957 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LatO54957 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LatO54957 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LatO54957 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LatO54957 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LatO54957 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LatO54957 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LatO54957 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LatO54957 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LatO54957 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LatO54957 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LatO54957 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LatO54957 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LatO54957 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LatO54957 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LatO54957 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LatO54957 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LatO54957 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LatO54957 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LatO54957 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LatO54957 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LatO54957 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LatO54957 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LatO54957 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LatO54957 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LatO54957 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LatO54957 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LatO54957 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LatO54957 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LatO54957 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LatO54957 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LatO54957 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LatO54957 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LatO54957 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LatO54957 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LatO54957 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LatO54957 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LatO54957 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LatO54957 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LatO54957 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LatO54957 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LatO54957 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LatO54957 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms